Bioinformatikus

Feladatok: Új generációs szekvenálási (NGS) adatok - kiemelten archaikus DNS (aDNA) szekvenciák - bioinformatikai feldolgozása, minőségellenőrzése, igazítása (alignment) és variánsazonosítása.Archaikus DNS-re jellemző károsodási mintázatok (deamináció, DNS-fragmentáció) elemzése és szűrése (pl. mapDamage).Populációgenetikai elemzések elvégzése és modellezése (pl. PCA, ADMIXTURE, qpAdm/qpGraph, f-statisztikák, IBD szegmensek vizsgálata).Reprodukálható bioinformatikai csővezetékek (pipelines) fejlesztése és karbantartása Linux/Unix környezetben (pl. Nextflow, Snakemake, Python, R).Genotipizálási és imputálási munkafolyamatok kezelése VCF és kapcsolódó fájlformátumokon.Szoros együttműködés a molekuláris biológiai wet-lab csapattal, archeológusokkal és történészekkel az eredmények biológiai és történeti értelmezésében.Tudományos publikációk, elemzési riportok és szakmai beszámolók elkészítésében való aktív részvétel. Elvárások: Új generációs szekvenálási (NGS) adatok - kiemelten archaikus DNS (aDNA) szekvenciák - bioinformatikai feldolgozása, minőségellenőrzése, igazítása (alignment) és variánsazonosítása.Archaikus DNS-re jellemző károsodási mintázatok (deamináció, DNS-fragmentáció) elemzése és szűrése (pl. mapDamage).Populációgenetikai elemzések elvégzése és modellezése (pl. PCA, ADMIXTURE, qpAdm/qpGraph, f-statisztikák, IBD szegmensek vizsgálata).Reprodukálható bioinformatikai csővezetékek (pipelines) fejlesztése és karbantartása Linux/Unix környezetben (pl. Nextflow, Snakemake, Python, R).Genotipizálási és imputálási munkafolyamatok kezelése VCF és kapcsolódó fájlformátumokon.Szoros együttműködés a molekuláris biológiai wet-lab csapattal, archeológusokkal és történészekkel az eredmények biológiai és történeti értelmezésében.Tudományos publikációk, elemzési riportok és szakmai beszámolók elkészítésében való aktív részvétel.Egyéb tudomány; Kutató; Biológus

A jelentkezés a partnerünk weboldalán keresztül történik